在高速信号调试时工程师必须首先调试并验证其设计是否符合物理层规范。在此阶段，信号完整性(如眼图和抖动)是关键问题，很多这种验证和调试是通过使用伪随机码序列(PRBS)或循环测试码，并结合示波器及示波器厂家提供的串行数据眼图和抖动分析软件来完成的。

    在确保物理层信号质量没有问题后，串行信号从测试码变为8b/10b编码字符序列，此时系统级问题成为调试的重点，问题可能会出现在物理层-链路层域(涉及信号完整性和数据完整性的交叉领域)。这时，就需要对物理层信号实现解码分析。

    对于现代的高速串行系统，系统之间的协调工作显得更为突出，协议间的任何冲突也会导致整个系统出现问题，因此分析物理层和链路层往往还是不够的，还必须要对系统的协议层进行分析，这时往往需要用到专用的协议分析仪。